Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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RRN3P1Q2M238 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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RRN3P1Q2M238 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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RRN3P1Q2M238 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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RRN3P1Q2M238 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RRN3P1Q2M238 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RRN3P1Q2M238 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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