Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NID2Q14112 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID2Q14112 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID2Q14112 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID2Q14112 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID2Q14112 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID2Q14112 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID2Q14112 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID2Q14112 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID2Q14112 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID2Q14112 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NID2Q14112 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID2Q14112 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NID2Q14112 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NID2Q14112 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID2Q14112 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID2Q14112 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID2Q14112 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID2Q14112 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID2Q14112 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID2Q14112 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID2Q14112 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID2Q14112 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID2Q14112 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID2Q14112 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID2Q14112 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID2Q14112 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NID2Q14112 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NID2Q14112 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NID2Q14112 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NID2Q14112 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NID2Q14112 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NID2Q14112 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NID2Q14112 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NID2Q14112 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NID2Q14112 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NID2Q14112 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NID2Q14112 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NID2Q14112 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NID2Q14112 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NID2Q14112 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NID2Q14112 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NID2Q14112 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NID2Q14112 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NID2Q14112 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NID2Q14112 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NID2Q14112 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NID2Q14112 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NID2Q14112 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NID2Q14112 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NID2Q14112 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NID2Q14112 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NID2Q14112 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NID2Q14112 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID2Q14112 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID2Q14112 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID2Q14112 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID2Q14112 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID2Q14112 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID2Q14112 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID2Q14112 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID2Q14112 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NID2Q14112 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID2Q14112 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID2Q14112 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NID2Q14112 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NID2Q14112 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NID2Q14112 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NID2Q14112 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NID2Q14112 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NID2Q14112 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NID2Q14112 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NID2Q14112 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NID2Q14112 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NID2Q14112 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NID2Q14112 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NID2Q14112 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NID2Q14112 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NID2Q14112 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NID2Q14112 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NID2Q14112 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NID2Q14112 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
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