Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHMG1C9JSJ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHMG1C9JSJ3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms