Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARFGEF2Q9Y6D5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARFGEF2Q9Y6D5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms