Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP58Q9Y2X3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOP58Q9Y2X3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms