Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSBN1Q5VWQ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms