Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOHLH1Q5JUK2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms