Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 RAD26YJR035W 3258 nt3.57□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YJR037WYJR037W 384 nt3.57□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 SEC14YMR079W 915 nt3.57□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 DIA2YOR080W 2199 nt3.57□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 ATP22YDR350C 2055 nt3.56□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 MED1YPR070W 1701 nt3.56□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt3.56□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 NTC20YBR188C 423 nt3.56□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 ROM1YGR070W 3468 nt3.56□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 SIZ1YDR409W 2715 nt3.56□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 NUP159YIL115C 4383 nt3.56□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 PSK1YAL017W 4071 nt3.55□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 SKO1YNL167C 1944 nt3.55□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.55□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 PRP38YGR075C 729 nt3.55□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt3.55□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YIL082WYIL082W 873 nt3.55□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.55□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.55□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.55□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.55□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 RPL23AYBL087C 414 nt3.55□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 ABP140YOR239W 1887 nt3.55□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 EXO84YBR102C 2262 nt3.55□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 XRS2YDR369C 2565 nt3.55□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 MAL33YBR297W 1407 nt3.54□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 COG2YGR120C 789 nt3.54□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YIR040CYIR040C 333 nt3.54□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 RPS21AYKR057W 264 nt3.54□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 RAD33YML011C 534 nt3.54□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YMR141CYMR141C 309 nt3.54□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 AFT2YPL202C 1251 nt3.54□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 GUP1YGL084C 1683 nt3.54□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 SPA2YLL021W 4401 nt3.54□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 RPN3YER021W 1572 nt3.54□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 JJJ2YJL162C 1752 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 XRN1YGL173C 4587 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 SNA4YDL123W 423 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YDL163WYDL163W 303 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 FAR7YFR008W 666 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 ERP6YGL002W 651 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YGL159WYGL159W 1113 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YJL086CYJL086C 369 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 SRP21YKL122C 504 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 VMA6YLR447C 1038 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YNL235CYNL235C 432 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 NGL1YOL042W 1092 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YPL276WYPL276W 438 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 Q0017Q0017 162 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 SLN1YIL147C 3663 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YKL100CYKL100C 1764 nt3.53□□□□□ -1.84
NYV1Q12255 YNL193WYNL193W 1677 nt3.52□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 CHA4YLR098C 1947 nt3.52□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 YIL169CYIL169C 2988 nt3.52□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 PEX1YKL197C 3132 nt3.52□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 YDR338CYDR338C 2088 nt3.52□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 SRB4YER022W 2064 nt3.52□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 VMA21YGR105W 234 nt3.52□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 RPL27AYHR010W 411 nt3.52□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 YHR213WYHR213W 597 nt3.52□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 YAR062WYAR062W 597 nt3.52□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 YBR051WYBR051W 351 nt3.52□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 YPR050CYPR050C 414 nt3.52□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 VHR2YER064C 1518 nt3.51□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 CDH1YGL003C 1701 nt3.51□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 YHL005CYHL005C 393 nt3.51□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 CSI1YMR025W 888 nt3.51□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 snR43snR43 209 nt3.51□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 ADY4YLR227C 1482 nt3.51□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 NSP1YJL041W 2472 nt3.51□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.51□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 SWC4YGR002C 1431 nt3.51□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 ILS1YBL076C 3219 nt3.51□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 TFC1YBR123C 1950 nt3.51□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 YAK1YJL141C 2424 nt3.5□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 DRS2YAL026C 4068 nt3.5□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 PRE1YER012W 597 nt3.5□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 CKA1YIL035C 1119 nt3.5□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 YJR087WYJR087W 351 nt3.5□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 RPS28BYLR264W 204 nt3.5□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 IRC21YMR073C 606 nt3.5□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 SFM1YOR021C 642 nt3.5□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 CSM4YPL200W 471 nt3.5□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 YBR062CYBR062C 543 nt3.5□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 SQS1YNL224C 2304 nt3.5□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 TFB1YDR311W 1929 nt3.5□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 VPS41YDR080W 2979 nt3.49□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 SCY1YGL083W 2415 nt3.49□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 TCB2YNL087W 3537 nt3.49□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 RPS21BYJL136C 264 nt3.49□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt3.49□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 YNL043CYNL043C 321 nt3.49□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 YBR300CYBR300C 498 nt3.49□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 SEN54YPL083C 1404 nt3.49□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 NMA111YNL123W 2994 nt3.49□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 MTR4YJL050W 3222 nt3.49□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 MFB1YDR219C 1398 nt3.49□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 TCP1YDR212W 1680 nt3.49□□□□□ -1.85
NYV1Q12255 SSP1YHR184W 1716 nt3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.8 ms