Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 CBS1YDL069C 690 nt3.42□□□□□ -1.86
NIC96P34077 FIN1YDR130C 876 nt3.42□□□□□ -1.86
NIC96P34077 SWS2YNL081C 432 nt3.42□□□□□ -1.86
NIC96P34077 YNL122CYNL122C 348 nt3.42□□□□□ -1.86
NIC96P34077 BUD21YOR078W 645 nt3.42□□□□□ -1.86
NIC96P34077 TFB1YDR311W 1929 nt3.42□□□□□ -1.86
NIC96P34077 NOG1YPL093W 1944 nt3.42□□□□□ -1.86
NIC96P34077 PCI8YIL071C 1335 nt3.42□□□□□ -1.86
NIC96P34077 FAA2YER015W 2235 nt3.42□□□□□ -1.86
NIC96P34077 IOC3YFR013W 2364 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 YKL222CYKL222C 2118 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 PBS2YJL128C 2007 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 YCR090CYCR090C 549 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 YDR537CYDR537C 606 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 MRM2YGL136C 963 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 YGR018CYGR018C 330 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 UTP11YKL099C 753 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 ILV5YLR355C 1188 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 PDP3YLR455W 915 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 RIM9YMR063W 720 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 YMR144WYMR144W 1029 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 RSA1YPL193W 1146 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 YPL205CYPL205C 345 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 ENA5YDR038C 3276 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 ENA2YDR039C 3276 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 ENA1YDR040C 3276 nt3.41□□□□□ -1.86
NIC96P34077 SMC3YJL074C 3693 nt3.4□□□□□ -1.86
NIC96P34077 SSL1YLR005W 1386 nt3.4□□□□□ -1.86
NIC96P34077 SPR3YGR059W 1539 nt3.4□□□□□ -1.86
NIC96P34077 PPQ1YPL179W 1650 nt3.4□□□□□ -1.86
NIC96P34077 IRC2YDR112W 309 nt3.4□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YGR042WYGR042W 816 nt3.4□□□□□ -1.87
NIC96P34077 COX23YHR116W 456 nt3.4□□□□□ -1.87
NIC96P34077 IGO2YHR132W-A 396 nt3.4□□□□□ -1.87
NIC96P34077 FYV7YLR068W 456 nt3.4□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YMR141CYMR141C 309 nt3.4□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YKL100CYKL100C 1764 nt3.4□□□□□ -1.87
NIC96P34077 BIT61YJL058C 1632 nt3.4□□□□□ -1.87
NIC96P34077 TRS120YDR407C 3870 nt3.4□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.4□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.4□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.4□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.4□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.4□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YCL019WYCL019W 5313 nt3.4□□□□□ -1.87
NIC96P34077 MED1YPR070W 1701 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YEL1YBL060W 2064 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YDR271CYDR271C 372 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 STE14YDR410C 720 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YGR045CYGR045C 363 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 MCR1YKL150W 909 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 SHH3YMR118C 591 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 ATG3YNR007C 933 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 RET3YPL010W 570 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 ROD1YOR018W 2514 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 TAF1YGR274C 3201 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 PEX1YKL197C 3132 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 RIX1YHR197W 2292 nt3.39□□□□□ -1.87
NIC96P34077 OPI6YDL096C 327 nt3.38□□□□□ -1.87
NIC96P34077 ECO1YFR027W 846 nt3.38□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YIL012WYIL012W 342 nt3.38□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YJL007CYJL007C 315 nt3.38□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.38□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.38□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.38□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.38□□□□□ -1.87
NIC96P34077 CDC123YLR215C 1083 nt3.38□□□□□ -1.87
NIC96P34077 SEA4YBL104C 3117 nt3.38□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt3.38□□□□□ -1.87
NIC96P34077 NMA111YNL123W 2994 nt3.38□□□□□ -1.87
NIC96P34077 CEP3YMR168C 1827 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 FLO9YAL063C 3969 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 MET32YDR253C 576 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YGR242WYGR242W 309 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YLR252WYLR252W 306 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 FLD1YLR404W 858 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 BER1YLR412W 825 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 COQ5YML110C 924 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 UBX4YMR067C 1251 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 MRPL44YMR225C 297 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YNL043CYNL043C 321 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 RFC3YNL290W 1023 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 TFC1YBR123C 1950 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 VHR2YER064C 1518 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 ALY1YKR021W 2748 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 PSY4YBL046W 1326 nt3.37□□□□□ -1.87
NIC96P34077 SQS1YNL224C 2304 nt3.36□□□□□ -1.87
NIC96P34077 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt3.36□□□□□ -1.87
NIC96P34077 RPS26BYER131W 360 nt3.36□□□□□ -1.87
NIC96P34077 TIM10YHR005C-A 282 nt3.36□□□□□ -1.87
NIC96P34077 CIC1YHR052W 1131 nt3.36□□□□□ -1.87
NIC96P34077 TOA1YOR194C 861 nt3.36□□□□□ -1.87
NIC96P34077 RPL20BYOR312C 519 nt3.36□□□□□ -1.87
NIC96P34077 DER1YBR201W 636 nt3.36□□□□□ -1.87
NIC96P34077 URA2YJL130C 6645 nt3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.1 ms