Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR4

FAM19A4, Protein FAM19A4, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM19A4Q96LR4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FAM19A4Q96LR4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FAM19A4Q96LR4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FAM19A4Q96LR4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM19A4Q96LR4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM19A4Q96LR4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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