Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF4Q2M2E3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms