Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIF1AQ16665 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIF1AQ16665 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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