Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM28Q13263 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM28Q13263 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
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