Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
REG1BP48304 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
REG1BP48304 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
REG1BP48304 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
REG1BP48304 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
REG1BP48304 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
REG1BP48304 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
REG1BP48304 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REG1BP48304 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REG1BP48304 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REG1BP48304 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
REG1BP48304 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REG1BP48304 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
REG1BP48304 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REG1BP48304 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
REG1BP48304 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
REG1BP48304 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
REG1BP48304 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
REG1BP48304 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
REG1BP48304 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
REG1BP48304 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
REG1BP48304 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG1BP48304 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG1BP48304 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG1BP48304 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG1BP48304 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG1BP48304 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG1BP48304 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG1BP48304 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG1BP48304 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG1BP48304 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG1BP48304 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG1BP48304 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG1BP48304 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
REG1BP48304 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
REG1BP48304 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms