Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TK1P04183 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TK1P04183 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TK1P04183 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TK1P04183 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TK1P04183 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TK1P04183 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TK1P04183 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TK1P04183 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TK1P04183 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TK1P04183 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TK1P04183 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TK1P04183 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TK1P04183 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TK1P04183 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TK1P04183 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TK1P04183 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TK1P04183 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TK1P04183 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TK1P04183 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TK1P04183 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TK1P04183 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms