Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXD3Q9UJU5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms