Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRMT12Q53H54 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRMT12Q53H54 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms