Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUNX1Q01196 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms