Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHKA1P46020 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHKA1P46020 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHKA1P46020 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms