Protein–RNA interactions for Protein: P35209

SPT21, Protein SPT21, yeastyeast

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT21P35209 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 MIC19YFR011C 513 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 VEL1YGL258W 621 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 VPS55YJR044C 423 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 SRL1YOR247W 633 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 ATG20YDL113C 1923 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 HSP104YLL026W 2727 nt7.16□□□□□ -1.26
SPT21P35209 NRD1YNL251C 1728 nt7.15□□□□□ -1.26
SPT21P35209 HOYDL227C 1761 nt7.15□□□□□ -1.26
SPT21P35209 YFL042CYFL042C 2025 nt7.15□□□□□ -1.26
SPT21P35209 IDP1YDL066W 1287 nt7.15□□□□□ -1.26
SPT21P35209 PSY1YKL076C 384 nt7.15□□□□□ -1.26
SPT21P35209 RHO2YNL090W 579 nt7.15□□□□□ -1.26
SPT21P35209 PPG1YNR032W 1107 nt7.15□□□□□ -1.26
SPT21P35209 ARX1YDR101C 1782 nt7.15□□□□□ -1.27
SPT21P35209 CTM1YHR109W 1758 nt7.15□□□□□ -1.27
SPT21P35209 CRZ1YNL027W 2037 nt7.15□□□□□ -1.27
SPT21P35209 MFA1YDR461W 111 nt7.14□□□□□ -1.27
SPT21P35209 MTC3YGL226W 372 nt7.14□□□□□ -1.27
SPT21P35209 YPL238CYPL238C 390 nt7.14□□□□□ -1.27
SPT21P35209 RIM13YMR154C 2184 nt7.13□□□□□ -1.27
SPT21P35209 SYO1YDL063C 1863 nt7.13□□□□□ -1.27
SPT21P35209 COX9YDL067C 180 nt7.13□□□□□ -1.27
SPT21P35209 RPS13YDR064W 456 nt7.13□□□□□ -1.27
SPT21P35209 YIR040CYIR040C 333 nt7.13□□□□□ -1.27
SPT21P35209 YKL223WYKL223W 333 nt7.13□□□□□ -1.27
SPT21P35209 MEH1YKR007W 555 nt7.13□□□□□ -1.27
SPT21P35209 TDA5YLR426W 981 nt7.13□□□□□ -1.27
SPT21P35209 REI1YBR267W 1182 nt7.13□□□□□ -1.27
SPT21P35209 CTS1YLR286C 1689 nt7.12□□□□□ -1.27
SPT21P35209 HDA2YDR295C 2025 nt7.12□□□□□ -1.27
SPT21P35209 YCR050CYCR050C 309 nt7.12□□□□□ -1.27
SPT21P35209 RPS5YJR123W 678 nt7.12□□□□□ -1.27
SPT21P35209 PRE8YML092C 753 nt7.12□□□□□ -1.27
SPT21P35209 BYE1YKL005C 1785 nt7.12□□□□□ -1.27
SPT21P35209 MRP10YDL045W-A 288 nt7.11□□□□□ -1.27
SPT21P35209 RPC11YDR045C 333 nt7.11□□□□□ -1.27
SPT21P35209 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.11□□□□□ -1.27
SPT21P35209 BUD5YCR038C 1929 nt7.11□□□□□ -1.27
SPT21P35209 YOL036WYOL036W 2286 nt7.11□□□□□ -1.27
SPT21P35209 ICL1YER065C 1674 nt7.1□□□□□ -1.27
SPT21P35209 MNT2YGL257C 1677 nt7.1□□□□□ -1.27
SPT21P35209 YET3YDL072C 612 nt7.1□□□□□ -1.27
SPT21P35209 FRQ1YDR373W 573 nt7.1□□□□□ -1.27
SPT21P35209 YER066C-AYER066C-A 501 nt7.1□□□□□ -1.27
SPT21P35209 PET191YJR034W 327 nt7.1□□□□□ -1.27
SPT21P35209 EDE1YBL047C 4146 nt7.09□□□□□ -1.27
SPT21P35209 RNR3YIL066C 2610 nt7.09□□□□□ -1.27
SPT21P35209 YSW1YBR148W 1830 nt7.09□□□□□ -1.27
SPT21P35209 SMD1YGR074W 441 nt7.09□□□□□ -1.27
SPT21P35209 SCW4YGR279C 1161 nt7.09□□□□□ -1.27
SPT21P35209 DIB1YPR082C 432 nt7.09□□□□□ -1.27
SPT21P35209 TPD3YAL016W 1908 nt7.09□□□□□ -1.27
SPT21P35209 STE14YDR410C 720 nt7.08□□□□□ -1.28
SPT21P35209 OLI1Q0130 231 nt7.08□□□□□ -1.28
SPT21P35209 ILV5YLR355C 1188 nt7.08□□□□□ -1.28
SPT21P35209 YNL010WYNL010W 726 nt7.08□□□□□ -1.28
SPT21P35209 YJL132WYJL132W 2253 nt7.07□□□□□ -1.28
SPT21P35209 GCN3YKR026C 918 nt7.07□□□□□ -1.28
SPT21P35209 RDN58-1RDN58-1 158 nt7.07□□□□□ -1.28
SPT21P35209 RDN58-2RDN58-2 158 nt7.07□□□□□ -1.28
SPT21P35209 SHH3YMR118C 591 nt7.07□□□□□ -1.28
SPT21P35209 URC2YDR520C 2319 nt7.07□□□□□ -1.28
SPT21P35209 STI1YOR027W 1770 nt7.07□□□□□ -1.28
SPT21P35209 SKG3YLR187W 3081 nt7.07□□□□□ -1.28
SPT21P35209 VPS5YOR069W 2028 nt7.06□□□□□ -1.28
SPT21P35209 YLL007CYLL007C 1998 nt7.06□□□□□ -1.28
SPT21P35209 TPA1YER049W 1935 nt7.06□□□□□ -1.28
SPT21P35209 ATO3YDR384C 828 nt7.06□□□□□ -1.28
SPT21P35209 MGR1YCL044C 1254 nt7.06□□□□□ -1.28
SPT21P35209 MDM30YLR368W 1797 nt7.05□□□□□ -1.28
SPT21P35209 SYP1YCR030C 2613 nt7.05□□□□□ -1.28
SPT21P35209 snR68snR68 136 nt7.05□□□□□ -1.28
SPT21P35209 ADK1YDR226W 669 nt7.05□□□□□ -1.28
SPT21P35209 COG8YML071C 1824 nt7.05□□□□□ -1.28
SPT21P35209 HIS7YBR248C 1659 nt7.05□□□□□ -1.28
SPT21P35209 PYC2YBR218C 3543 nt7.05□□□□□ -1.28
SPT21P35209 FOB1YDR110W 1701 nt7.04□□□□□ -1.28
SPT21P35209 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.04□□□□□ -1.28
SPT21P35209 PAU2YEL049W 363 nt7.04□□□□□ -1.28
SPT21P35209 RPL11BYGR085C 525 nt7.04□□□□□ -1.28
SPT21P35209 RPL11AYPR102C 525 nt7.04□□□□□ -1.28
SPT21P35209 LRE1YCL051W 1752 nt7.04□□□□□ -1.28
SPT21P35209 CUL3YGR003W 2235 nt7.04□□□□□ -1.28
SPT21P35209 RPS16BYDL083C 432 nt7.03□□□□□ -1.28
SPT21P35209 AAD15YOL165C 432 nt7.03□□□□□ -1.28
SPT21P35209 VTC2YFL004W 2487 nt7.03□□□□□ -1.28
SPT21P35209 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt7.02□□□□□ -1.29
SPT21P35209 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt7.02□□□□□ -1.29
SPT21P35209 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt7.02□□□□□ -1.29
SPT21P35209 UBA1YKL210W 3075 nt7.02□□□□□ -1.29
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