Protein–RNA interactions for Protein: P23508

MCC, Colorectal mutant cancer protein, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCP23508 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCP23508 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCP23508 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCP23508 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCP23508 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCP23508 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCP23508 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCP23508 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCP23508 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCP23508 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCP23508 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCP23508 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCP23508 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCP23508 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCCP23508 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCCP23508 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCP23508 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCP23508 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCP23508 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCP23508 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCP23508 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCP23508 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCP23508 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCP23508 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCP23508 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCCP23508 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCCP23508 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCCP23508 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCCP23508 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCCP23508 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCP23508 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCP23508 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCP23508 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCP23508 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCP23508 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCP23508 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCP23508 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCP23508 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCP23508 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCP23508 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCP23508 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCP23508 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCP23508 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCCP23508 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCP23508 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCP23508 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCP23508 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCP23508 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCP23508 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCP23508 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCP23508 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCP23508 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCP23508 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCCP23508 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCCP23508 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms