Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRAP19793 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRAP19793 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRAP19793 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRAP19793 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRAP19793 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRAP19793 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRAP19793 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRAP19793 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRAP19793 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRAP19793 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RXRAP19793 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RXRAP19793 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RXRAP19793 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RXRAP19793 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RXRAP19793 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RXRAP19793 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RXRAP19793 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RXRAP19793 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RXRAP19793 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RXRAP19793 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RXRAP19793 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RXRAP19793 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRAP19793 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRAP19793 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRAP19793 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRAP19793 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRAP19793 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRAP19793 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRAP19793 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRAP19793 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRAP19793 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRAP19793 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRAP19793 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RXRAP19793 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RXRAP19793 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RXRAP19793 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RXRAP19793 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RXRAP19793 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RXRAP19793 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RXRAP19793 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RXRAP19793 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RXRAP19793 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RXRAP19793 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms