Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL2P13500 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL2P13500 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL2P13500 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL2P13500 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL2P13500 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL2P13500 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL2P13500 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL2P13500 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL2P13500 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL2P13500 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL2P13500 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL2P13500 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL2P13500 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL2P13500 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL2P13500 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL2P13500 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL2P13500 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL2P13500 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL2P13500 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL2P13500 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL2P13500 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL2P13500 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL2P13500 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL2P13500 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL2P13500 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL2P13500 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCL2P13500 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL2P13500 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL2P13500 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL2P13500 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL2P13500 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.6 ms