Protein–RNA interactions for Protein: P0CF16

YML003W, UPF0507 protein YML003W, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML003WP0CF16 KAR9YPL269W 1935 nt3.27□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 COP1YDL145C 3606 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 ERG11YHR007C 1593 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 GAL80YML051W 1308 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 FAT1YBR041W 2010 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YCR001WYCR001W 315 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 RPS0AYGR214W 759 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 BCD1YHR040W 1101 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 CIC1YHR052W 1131 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YHR213WYHR213W 597 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 HIS5YIL116W 1158 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 SYS1YJL004C 612 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 TDA8YAL064C-A 381 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YAR062WYAR062W 597 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 UBX4YMR067C 1251 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 RPL13BYMR142C 600 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 SWS2YNL081C 432 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YNL122CYNL122C 348 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 snR17asnR17a 333 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YBR062CYBR062C 543 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 MUS81YDR386W 1899 nt3.26□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YDR338CYDR338C 2088 nt3.25□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 MRPL11YDL202W 750 nt3.25□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YDR133CYDR133C 336 nt3.25□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 MET32YDR253C 576 nt3.25□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 VPS74YDR372C 1038 nt3.25□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 IES6YEL044W 501 nt3.25□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 CHZ1YER030W 462 nt3.25□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 RTT105YER104W 627 nt3.25□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 PDX1YGR193C 1233 nt3.25□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YHL026CYHL026C 948 nt3.25□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 DPH1YIL103W 1278 nt3.25□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 ASI2YNL159C 870 nt3.25□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 SPC29YPL124W 762 nt3.25□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 SWC4YGR002C 1431 nt3.25□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 SPA2YLL021W 4401 nt3.25□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YCR085WYCR085W 354 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YGL159WYGL159W 1113 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 SPT4YGR063C 309 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 IGO2YHR132W-A 396 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 BET4YJL031C 984 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 ANB1YJR047C 474 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 CSE4YKL049C 690 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YKL202WYKL202W 582 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 ARC18YLR370C 537 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 PDP3YLR455W 915 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 RUF22RUF22 515 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 PDR17YNL264C 1053 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YPL088WYPL088W 1029 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 SCD6YPR129W 1050 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YPR177CYPR177C 372 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 DAN4YJR151C 3486 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 ALA1YOR335C 2877 nt3.24□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 HOP1YIL072W 1818 nt3.23□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YLR352WYLR352W 2424 nt3.23□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt3.23□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 EMI1YDR512C 564 nt3.23□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 RPS8BYER102W 603 nt3.23□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 CDC26YFR036W 375 nt3.23□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YGL152CYGL152C 678 nt3.23□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 ACF4YJR083C 930 nt3.23□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 JEN1YKL217W 1851 nt3.23□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YPT7YML001W 627 nt3.23□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 RAD14YMR201C 1116 nt3.23□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YBR051WYBR051W 351 nt3.23□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 SCY1YGL083W 2415 nt3.23□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 PWP2YCR057C 2772 nt3.23□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 NCS2YNL119W 1482 nt3.22□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 EAP1YKL204W 1899 nt3.22□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 DSF2YBR007C 2211 nt3.22□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 SNA4YDL123W 423 nt3.22□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 RSM24YDR175C 960 nt3.22□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 VMA8YEL051W 771 nt3.22□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 VEL1YGL258W 621 nt3.22□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YJL169WYJL169W 369 nt3.22□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 BER1YLR412W 825 nt3.22□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt3.22□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YOR277CYOR277C 309 nt3.22□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YPL142CYPL142C 318 nt3.22□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 YPR077CYPR077C 372 nt3.22□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 SYT1YPR095C 3681 nt3.22□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.22□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 FAR8YMR029C 1572 nt3.21□□□□□ -1.89
YML003WP0CF16 GYL1YMR192W 2163 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 SKO1YNL167C 1944 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 PCK1YKR097W 1650 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 RAD4YER162C 2265 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 SHE4YOR035C 2370 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 snR59snR59 78 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 YDR199WYDR199W 366 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 PRM8YGL053W 714 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 MRM2YGL136C 963 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 PET54YGR222W 882 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 RPF1YHR088W 888 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 YJL086CYJL086C 369 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 SOD1YJR104C 465 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 YJR157WYJR157W 363 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 YLR224WYLR224W 1110 nt3.21□□□□□ -1.9
YML003WP0CF16 RRT1YBL048W 312 nt3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 111.7 ms