Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PPARGC1BQ86YN6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PPARGC1BQ86YN6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms