Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIGQ13278 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIGQ13278 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIGQ13278 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIGQ13278 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIGQ13278 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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