Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 RGL1YPL066W 1440 nt3.4□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YPR170CYPR170C 336 nt3.4□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 MRPS9YBR146W 837 nt3.4□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YGR237CYGR237C 2358 nt3.4□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 CDC5YMR001C 2118 nt3.4□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YCT1YLL055W 1596 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 RSC1YGR056W 2787 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YDR526CYDR526C 471 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 PMI40YER003C 1290 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SEC4YFL005W 648 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 TIM10YHR005C-A 282 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 EAF6YJR082C 342 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 TPK3YKL166C 1197 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 RPL22AYLR061W 366 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SYM1YLR251W 594 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YLR252WYLR252W 306 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 OCA2YNL056W 594 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 TOA1YOR194C 861 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 PRM3YPL192C 402 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 HUL5YGL141W 2733 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 RDS2YPL133C 1341 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 THR4YCR053W 1545 nt3.39□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 GPI13YLL031C 3054 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SRP1YNL189W 1629 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SLU7YDR088C 1149 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SPT2YER161C 1002 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SLX9YGR081C 633 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YLR416CYLR416C 399 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SWS2YNL081C 432 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 ATX2YOR079C 942 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 PHO88YBR106W 567 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 PHR1YOR386W 1698 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 RSF2YJR127C 4143 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 RAD5YLR032W 3510 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 RTT109YLL002W 1311 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 ERG11YHR007C 1593 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 GDS1YOR355W 1569 nt3.38□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SPA2YLL021W 4401 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 URA2YJL130C 6645 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SEC15YGL233W 2733 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SET1YHR119W 3243 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SWI1YPL016W 3945 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 RAD26YJR035W 3258 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SSM4YIL030C 3960 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 RAD2YGR258C 3096 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 UPF3YGR072W 1164 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 CIC1YHR052W 1131 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YJL119CYJL119C 324 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 AIM26YKL037W 357 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 RPB5YBR154C 648 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 PIN4YBL051C 2007 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YML096WYML096W 1578 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 RPN2YIL075C 2838 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 STE24YJR117W 1362 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SLY41YOR307C 1362 nt3.37□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 HRD1YOL013C 1656 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 ARP5YNL059C 2268 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 PBP4YDL053C 558 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 VAB2YEL005C 849 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 GPP2YER062C 753 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YHR097CYHR097C 1101 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SDL1YIL167W 633 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YJR037WYJR037W 384 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 EMC2YJR088C 879 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 ATG10YLL042C 504 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YNL046WYNL046W 519 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 HHF1YBR009C 312 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 RPA43YOR340C 981 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 KIN3YAR018C 1308 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 NUP60YAR002W 1620 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 VPS30YPL120W 1674 nt3.36□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 DUN1YDL101C 1542 nt3.35□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 KAP95YLR347C 2586 nt3.35□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 ASM4YDL088C 1587 nt3.35□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 MDN1YLR106C 14733 nt3.35□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 PKH1YDR490C 2301 nt3.35□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YPD1YDL235C 504 nt3.35□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 LIF1YGL090W 1266 nt3.35□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 RSR1YGR152C 819 nt3.35□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 GOS1YHL031C 672 nt3.35□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YIL029CYIL029C 429 nt3.35□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 NFU1YKL040C 771 nt3.35□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YPL035CYPL035C 348 nt3.35□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt3.35□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt3.35□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 ITT1YML068W 1395 nt3.35□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 VPS33YLR396C 2076 nt3.34□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 MNT4YNR059W 1743 nt3.34□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 PEX10YDR265W 1014 nt3.34□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SNX4YJL036W 1272 nt3.34□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YKL115CYKL115C 393 nt3.34□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 SRP21YKL122C 504 nt3.34□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YLL044WYLL044W 447 nt3.34□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 TOM22YNL131W 459 nt3.34□□□□□ -1.87
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