Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTP1P59025 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTP1P59025 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP1P59025 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP1P59025 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP1P59025 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP1P59025 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP1P59025 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP1P59025 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP1P59025 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP1P59025 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP1P59025 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTP1P59025 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTP1P59025 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTP1P59025 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTP1P59025 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP1P59025 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP1P59025 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP1P59025 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP1P59025 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP1P59025 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP1P59025 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP1P59025 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP1P59025 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP1P59025 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP1P59025 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP1P59025 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTP1P59025 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTP1P59025 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms