Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEC24CP53992 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEC24CP53992 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms