Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRAP19793 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRAP19793 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRAP19793 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RXRAP19793 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RXRAP19793 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRAP19793 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRAP19793 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRAP19793 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRAP19793 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRAP19793 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRAP19793 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRAP19793 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRAP19793 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RXRAP19793 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RXRAP19793 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RXRAP19793 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RXRAP19793 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RXRAP19793 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RXRAP19793 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RXRAP19793 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RXRAP19793 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RXRAP19793 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RXRAP19793 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RXRAP19793 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RXRAP19793 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RXRAP19793 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RXRAP19793 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RXRAP19793 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RXRAP19793 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RXRAP19793 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RXRAP19793 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RXRAP19793 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RXRAP19793 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RXRAP19793 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRAP19793 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRAP19793 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRAP19793 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRAP19793 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRAP19793 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRAP19793 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRAP19793 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRAP19793 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRAP19793 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRAP19793 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRAP19793 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRAP19793 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRAP19793 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RXRAP19793 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms