Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A6NIN4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A6NIN4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A6NIN4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
A6NIN4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
A6NIN4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A6NIN4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A6NIN4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A6NIN4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A6NIN4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A6NIN4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A6NIN4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms