Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC78A2IDD5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms