Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.544e-6■■■■□ 24.7
UTP18Q9Y5J1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.54e-6■■■■□ 24.7
UTP18Q9Y5J1 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.89■□□□□ 0.939e-7■■■■□ 24.5
UTP18Q9Y5J1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.249e-7■■■■□ 24.5
UTP18Q9Y5J1 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.069e-7■■■■□ 24.5
UTP18Q9Y5J1 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.499e-7■■■■□ 24.5
UTP18Q9Y5J1 NOP58-208ENST00000488403 871 ntTSL 215.68■□□□□ 0.13e-61■■■■□ 24.4
UTP18Q9Y5J1 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 215.04■□□□□ -03e-61■■■■□ 24.4
UTP18Q9Y5J1 NOP58-204ENST00000467734 638 ntTSL 512.04□□□□□ -0.483e-61■■■■□ 24.4
UTP18Q9Y5J1 NOP58-205ENST00000472050 582 ntTSL 311.65□□□□□ -0.543e-61■■■■□ 24.4
UTP18Q9Y5J1 NOP58-209ENST00000492688 571 ntTSL 45.15□□□□□ -1.593e-61■■■■□ 24.4
UTP18Q9Y5J1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.124e-6■■■■□ 24.2
UTP18Q9Y5J1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.894e-6■■■■□ 24.2
UTP18Q9Y5J1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.874e-6■■■■□ 24.2
UTP18Q9Y5J1 FGFR3-209ENST00000507588 336 ntTSL 1 (best)19.57■□□□□ 0.724e-6■■■■□ 24.2
UTP18Q9Y5J1 FGFR3-207ENST00000474521 545 ntTSL 218.81■□□□□ 0.64e-6■■■■□ 24.2
UTP18Q9Y5J1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.544e-6■■■■□ 24.2
UTP18Q9Y5J1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.54e-6■■■■□ 24.2
UTP18Q9Y5J1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.224e-6■■■■□ 24.2
UTP18Q9Y5J1 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.144e-6■■■■□ 24.2
UTP18Q9Y5J1 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC8.95□□□□□ -0.983e-22■■■■□ 24.2
UTP18Q9Y5J1 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.463e-22■■■■□ 24.2
UTP18Q9Y5J1 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.653e-22■■■■□ 24.2
UTP18Q9Y5J1 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 43.47□□□□□ -1.853e-22■■■■□ 24.2
UTP18Q9Y5J1 HMGN2-202ENST00000460563 1045 ntTSL 511.12□□□□□ -0.633e-8■■■■□ 23.8
UTP18Q9Y5J1 HMGN2-204ENST00000464888 565 ntTSL 211.1□□□□□ -0.633e-8■■■■□ 23.8
UTP18Q9Y5J1 HMGN2-203ENST00000463817 853 ntTSL 29.45□□□□□ -0.93e-8■■■■□ 23.8
UTP18Q9Y5J1 HMGN2-208ENST00000479815 1030 ntTSL 59.45□□□□□ -0.93e-8■■■■□ 23.8
UTP18Q9Y5J1 HMGN2-206ENST00000467700 932 ntTSL 27.96□□□□□ -1.143e-8■■■■□ 23.8
UTP18Q9Y5J1 HMGN2-207ENST00000468388 320 ntTSL 37.35□□□□□ -1.233e-8■■■■□ 23.8
UTP18Q9Y5J1 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.233e-8■■■■□ 23.8
UTP18Q9Y5J1 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.473e-8■■■■□ 23.8
UTP18Q9Y5J1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.596e-7■■■■□ 23.5
UTP18Q9Y5J1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.313e-7■■■■□ 23.5
UTP18Q9Y5J1 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 223.22■■□□□ 1.313e-7■■■■□ 23.5
UTP18Q9Y5J1 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 220.75■□□□□ 0.916e-7■■■■□ 23.5
UTP18Q9Y5J1 GDI1-211ENST00000481304 1014 ntTSL 1 (best)17.27■□□□□ 0.366e-7■■■■□ 23.5
UTP18Q9Y5J1 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.053e-7■■■■□ 23.5
UTP18Q9Y5J1 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.073e-7■■■■□ 23.5
UTP18Q9Y5J1 GDI1-213ENST00000489589 918 ntTSL 212.72□□□□□ -0.376e-7■■■■□ 23.5
UTP18Q9Y5J1 GDI1-208ENST00000471972 534 ntTSL 211.91□□□□□ -0.56e-7■■■■□ 23.5
UTP18Q9Y5J1 GDI1-214ENST00000491154 4069 ntTSL 210.67□□□□□ -0.76e-7■■■■□ 23.5
UTP18Q9Y5J1 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 29.91□□□□□ -0.826e-7■■■■□ 23.5
UTP18Q9Y5J1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.411e-10■■■■□ 23.4
UTP18Q9Y5J1 PPP1R15A-202ENST00000600406 1725 nt17.52■□□□□ 0.41e-10■■■■□ 23.4
UTP18Q9Y5J1 DOT1L-203ENST00000452696 624 ntTSL 315.6■□□□□ 0.094e-6■■■■□ 23.1
UTP18Q9Y5J1 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.24e-6■■■■□ 23.1
UTP18Q9Y5J1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.064e-6■■■■□ 23.1
UTP18Q9Y5J1 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 38.24□□□□□ -1.091e-9■■■■□ 22.8
UTP18Q9Y5J1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.271e-8■■■■□ 22.8
UTP18Q9Y5J1 SRRM2-228ENST00000576878 1141 ntTSL 218.72■□□□□ 0.591e-8■■■■□ 22.8
UTP18Q9Y5J1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.571e-8■■■■□ 22.8
UTP18Q9Y5J1 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 316.63■□□□□ 0.252e-29■■■■□ 22.8
UTP18Q9Y5J1 SRRM2-204ENST00000570705 675 ntTSL 316.27■□□□□ 0.21e-8■■■■□ 22.8
UTP18Q9Y5J1 SRRM2-206ENST00000571041 498 ntTSL 415.89■□□□□ 0.131e-8■■■■□ 22.8
UTP18Q9Y5J1 SRRM2-213ENST00000573311 732 ntTSL 215.72■□□□□ 0.111e-8■■■■□ 22.8
UTP18Q9Y5J1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.375e-7■■■■□ 22.7
UTP18Q9Y5J1 C22orf34-202ENST00000400023 1469 ntTSL 1 (best)16.83■□□□□ 0.285e-7■■■■□ 22.7
UTP18Q9Y5J1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.342e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 C2orf48-202ENST00000619640 480 ntTSL 1 (best)16.46■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 RAD54L-210ENST00000488942 1121 ntTSL 313.2□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 MCM4-206ENST00000519138 927 ntTSL 213.13□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 MCM4-207ENST00000519170 734 ntTSL 312.04□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 RAD54L-202ENST00000442598 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 MCM4-209ENST00000520637 839 ntTSL 210.83□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 RAD54L-201ENST00000371975 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 RAD54L-203ENST00000459678 775 ntTSL 59.2□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 RAD54L-208ENST00000476687 574 ntTSL 27.58□□□□□ -1.22e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 CHD4-205ENST00000536301 107 ntTSL 35.16□□□□□ -1.582e-6■■■■□ 22.6
UTP18Q9Y5J1 WNK2-208ENST00000453718 1937 ntTSL 518.09■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 22.3
UTP18Q9Y5J1 WNK2-207ENST00000448251 3224 ntTSL 214.77□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 22.3
UTP18Q9Y5J1 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.51e-8■■■■□ 22.3
UTP18Q9Y5J1 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.085e-8■■■■□ 22.3
UTP18Q9Y5J1 CCAR1-207ENST00000536012 2447 ntTSL 1 (best)8.17□□□□□ -1.15e-8■■■■□ 22.3
UTP18Q9Y5J1 CCAR1-214ENST00000543225 2407 ntTSL 1 (best)7.29□□□□□ -1.245e-8■■■■□ 22.3
UTP18Q9Y5J1 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.275e-8■■■■□ 22.3
UTP18Q9Y5J1 CCAR1-215ENST00000543229 2475 ntTSL 26.97□□□□□ -1.295e-8■■■■□ 22.3
UTP18Q9Y5J1 CCAR1-213ENST00000541012 2432 ntTSL 1 (best)6.88□□□□□ -1.315e-8■■■■□ 22.3
UTP18Q9Y5J1 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.325e-8■■■■□ 22.3
UTP18Q9Y5J1 CCAR1-205ENST00000483264 487 ntTSL 56.36□□□□□ -1.395e-8■■■■□ 22.3
UTP18Q9Y5J1 CCAR1-211ENST00000539539 3224 ntTSL 24.61□□□□□ -1.675e-8■■■■□ 22.3
UTP18Q9Y5J1 CCAR1-212ENST00000540210 3415 ntTSL 1 (best)4.07□□□□□ -1.765e-8■■■■□ 22.3
UTP18Q9Y5J1 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.96□□□□□ -1.945e-8■■■■□ 22.3
UTP18Q9Y5J1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.951e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.711e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.61e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 324.04■■□□□ 1.441e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.421e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.245e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.115e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.055e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.875e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.865e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 516.43■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 22
Retrieved 100 of 2,623 protein–RNA pairs in 213.4 ms