Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN8AQ9UQD0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN8AQ9UQD0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN8AQ9UQD0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN8AQ9UQD0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN8AQ9UQD0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN8AQ9UQD0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN8AQ9UQD0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCN8AQ9UQD0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN8AQ9UQD0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN8AQ9UQD0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCN8AQ9UQD0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN8AQ9UQD0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCN8AQ9UQD0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN8AQ9UQD0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN8AQ9UQD0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN8AQ9UQD0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN8AQ9UQD0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN8AQ9UQD0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN8AQ9UQD0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCN8AQ9UQD0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCN8AQ9UQD0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCN8AQ9UQD0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCN8AQ9UQD0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCN8AQ9UQD0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCN8AQ9UQD0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCN8AQ9UQD0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN8AQ9UQD0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN8AQ9UQD0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN8AQ9UQD0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN8AQ9UQD0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN8AQ9UQD0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN8AQ9UQD0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN8AQ9UQD0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN8AQ9UQD0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN8AQ9UQD0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms