Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDH9Q9ULB4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CDH9Q9ULB4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDH9Q9ULB4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDH9Q9ULB4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH9Q9ULB4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CDH9Q9ULB4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDH9Q9ULB4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDH9Q9ULB4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDH9Q9ULB4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDH9Q9ULB4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDH9Q9ULB4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDH9Q9ULB4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDH9Q9ULB4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDH9Q9ULB4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDH9Q9ULB4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDH9Q9ULB4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDH9Q9ULB4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH9Q9ULB4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH9Q9ULB4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH9Q9ULB4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH9Q9ULB4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDH9Q9ULB4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDH9Q9ULB4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDH9Q9ULB4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDH9Q9ULB4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH9Q9ULB4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDH9Q9ULB4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDH9Q9ULB4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDH9Q9ULB4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDH9Q9ULB4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDH9Q9ULB4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDH9Q9ULB4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDH9Q9ULB4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDH9Q9ULB4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDH9Q9ULB4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDH9Q9ULB4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDH9Q9ULB4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CDH9Q9ULB4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDH9Q9ULB4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDH9Q9ULB4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDH9Q9ULB4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDH9Q9ULB4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDH9Q9ULB4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDH9Q9ULB4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDH9Q9ULB4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDH9Q9ULB4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDH9Q9ULB4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDH9Q9ULB4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDH9Q9ULB4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDH9Q9ULB4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH9Q9ULB4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH9Q9ULB4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH9Q9ULB4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDH9Q9ULB4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDH9Q9ULB4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDH9Q9ULB4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDH9Q9ULB4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDH9Q9ULB4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDH9Q9ULB4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDH9Q9ULB4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDH9Q9ULB4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDH9Q9ULB4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDH9Q9ULB4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDH9Q9ULB4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms