Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CASP8AP2Q9UKL3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CASP8AP2Q9UKL3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CASP8AP2Q9UKL3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CASP8AP2Q9UKL3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CASP8AP2Q9UKL3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CASP8AP2Q9UKL3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CASP8AP2Q9UKL3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CASP8AP2Q9UKL3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CASP8AP2Q9UKL3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CASP8AP2Q9UKL3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CASP8AP2Q9UKL3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CASP8AP2Q9UKL3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CASP8AP2Q9UKL3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CASP8AP2Q9UKL3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CASP8AP2Q9UKL3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CASP8AP2Q9UKL3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CASP8AP2Q9UKL3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CASP8AP2Q9UKL3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CASP8AP2Q9UKL3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CASP8AP2Q9UKL3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CASP8AP2Q9UKL3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CASP8AP2Q9UKL3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CASP8AP2Q9UKL3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CASP8AP2Q9UKL3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CASP8AP2Q9UKL3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CASP8AP2Q9UKL3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CASP8AP2Q9UKL3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CASP8AP2Q9UKL3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CASP8AP2Q9UKL3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CASP8AP2Q9UKL3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CASP8AP2Q9UKL3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CASP8AP2Q9UKL3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CASP8AP2Q9UKL3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CASP8AP2Q9UKL3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CASP8AP2Q9UKL3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CASP8AP2Q9UKL3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CASP8AP2Q9UKL3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CASP8AP2Q9UKL3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CASP8AP2Q9UKL3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CASP8AP2Q9UKL3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CASP8AP2Q9UKL3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CASP8AP2Q9UKL3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CASP8AP2Q9UKL3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms