Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV5

RAPGEFL1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEFL1Q9UHV5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RAPGEFL1Q9UHV5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEFL1Q9UHV5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAPGEFL1Q9UHV5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAPGEFL1Q9UHV5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEFL1Q9UHV5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEFL1Q9UHV5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEFL1Q9UHV5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEFL1Q9UHV5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEFL1Q9UHV5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEFL1Q9UHV5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEFL1Q9UHV5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEFL1Q9UHV5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEFL1Q9UHV5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEFL1Q9UHV5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEFL1Q9UHV5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEFL1Q9UHV5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEFL1Q9UHV5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEFL1Q9UHV5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEFL1Q9UHV5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEFL1Q9UHV5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEFL1Q9UHV5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEFL1Q9UHV5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEFL1Q9UHV5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEFL1Q9UHV5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEFL1Q9UHV5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEFL1Q9UHV5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEFL1Q9UHV5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEFL1Q9UHV5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEFL1Q9UHV5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEFL1Q9UHV5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAPGEFL1Q9UHV5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAPGEFL1Q9UHV5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAPGEFL1Q9UHV5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RAPGEFL1Q9UHV5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAPGEFL1Q9UHV5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAPGEFL1Q9UHV5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAPGEFL1Q9UHV5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAPGEFL1Q9UHV5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAPGEFL1Q9UHV5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAPGEFL1Q9UHV5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAPGEFL1Q9UHV5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAPGEFL1Q9UHV5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAPGEFL1Q9UHV5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAPGEFL1Q9UHV5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAPGEFL1Q9UHV5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAPGEFL1Q9UHV5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RAPGEFL1Q9UHV5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAPGEFL1Q9UHV5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAPGEFL1Q9UHV5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAPGEFL1Q9UHV5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAPGEFL1Q9UHV5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEFL1Q9UHV5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEFL1Q9UHV5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEFL1Q9UHV5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEFL1Q9UHV5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEFL1Q9UHV5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEFL1Q9UHV5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEFL1Q9UHV5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEFL1Q9UHV5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RAPGEFL1Q9UHV5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms