Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PCDH10Q9P2E7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCDH10Q9P2E7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCDH10Q9P2E7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PCDH10Q9P2E7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PCDH10Q9P2E7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCDH10Q9P2E7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCDH10Q9P2E7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCDH10Q9P2E7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PCDH10Q9P2E7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCDH10Q9P2E7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PCDH10Q9P2E7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCDH10Q9P2E7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCDH10Q9P2E7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCDH10Q9P2E7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PCDH10Q9P2E7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCDH10Q9P2E7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCDH10Q9P2E7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCDH10Q9P2E7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCDH10Q9P2E7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCDH10Q9P2E7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCDH10Q9P2E7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCDH10Q9P2E7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCDH10Q9P2E7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCDH10Q9P2E7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCDH10Q9P2E7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PCDH10Q9P2E7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCDH10Q9P2E7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCDH10Q9P2E7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCDH10Q9P2E7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PCDH10Q9P2E7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PCDH10Q9P2E7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PCDH10Q9P2E7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PCDH10Q9P2E7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PCDH10Q9P2E7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PCDH10Q9P2E7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PCDH10Q9P2E7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PCDH10Q9P2E7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PCDH10Q9P2E7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PCDH10Q9P2E7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PCDH10Q9P2E7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PCDH10Q9P2E7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCDH10Q9P2E7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCDH10Q9P2E7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCDH10Q9P2E7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCDH10Q9P2E7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCDH10Q9P2E7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDH10Q9P2E7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDH10Q9P2E7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDH10Q9P2E7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCDH10Q9P2E7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCDH10Q9P2E7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCDH10Q9P2E7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PCDH10Q9P2E7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCDH10Q9P2E7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCDH10Q9P2E7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCDH10Q9P2E7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCDH10Q9P2E7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCDH10Q9P2E7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PCDH10Q9P2E7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCDH10Q9P2E7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCDH10Q9P2E7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCDH10Q9P2E7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PCDH10Q9P2E7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PCDH10Q9P2E7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCDH10Q9P2E7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCDH10Q9P2E7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PCDH10Q9P2E7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCDH10Q9P2E7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCDH10Q9P2E7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCDH10Q9P2E7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PCDH10Q9P2E7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCDH10Q9P2E7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PCDH10Q9P2E7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCDH10Q9P2E7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PCDH10Q9P2E7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PCDH10Q9P2E7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PCDH10Q9P2E7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCDH10Q9P2E7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCDH10Q9P2E7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PCDH10Q9P2E7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDH10Q9P2E7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDH10Q9P2E7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDH10Q9P2E7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCDH10Q9P2E7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDH10Q9P2E7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDH10Q9P2E7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDH10Q9P2E7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PCDH10Q9P2E7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PCDH10Q9P2E7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCDH10Q9P2E7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PCDH10Q9P2E7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PCDH10Q9P2E7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PCDH10Q9P2E7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCDH10Q9P2E7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCDH10Q9P2E7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PCDH10Q9P2E7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCDH10Q9P2E7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PCDH10Q9P2E7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PCDH10Q9P2E7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms