Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TMOD3Q9NYL9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TMOD3Q9NYL9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TMOD3Q9NYL9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TMOD3Q9NYL9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TMOD3Q9NYL9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
TMOD3Q9NYL9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TMOD3Q9NYL9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TMOD3Q9NYL9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TMOD3Q9NYL9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
TMOD3Q9NYL9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
TMOD3Q9NYL9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TMOD3Q9NYL9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
TMOD3Q9NYL9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
TMOD3Q9NYL9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TMOD3Q9NYL9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
TMOD3Q9NYL9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TMOD3Q9NYL9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TMOD3Q9NYL9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TMOD3Q9NYL9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TMOD3Q9NYL9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TMOD3Q9NYL9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TMOD3Q9NYL9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TMOD3Q9NYL9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TMOD3Q9NYL9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TMOD3Q9NYL9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TMOD3Q9NYL9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TMOD3Q9NYL9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TMOD3Q9NYL9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TMOD3Q9NYL9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TMOD3Q9NYL9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TMOD3Q9NYL9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TMOD3Q9NYL9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TMOD3Q9NYL9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
TMOD3Q9NYL9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TMOD3Q9NYL9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TMOD3Q9NYL9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TMOD3Q9NYL9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TMOD3Q9NYL9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TMOD3Q9NYL9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TMOD3Q9NYL9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TMOD3Q9NYL9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TMOD3Q9NYL9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TMOD3Q9NYL9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TMOD3Q9NYL9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TMOD3Q9NYL9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TMOD3Q9NYL9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TMOD3Q9NYL9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TMOD3Q9NYL9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TMOD3Q9NYL9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TMOD3Q9NYL9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TMOD3Q9NYL9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TMOD3Q9NYL9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TMOD3Q9NYL9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TMOD3Q9NYL9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TMOD3Q9NYL9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TMOD3Q9NYL9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TMOD3Q9NYL9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TMOD3Q9NYL9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TMOD3Q9NYL9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TMOD3Q9NYL9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TMOD3Q9NYL9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
TMOD3Q9NYL9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TMOD3Q9NYL9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TMOD3Q9NYL9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TMOD3Q9NYL9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TMOD3Q9NYL9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TMOD3Q9NYL9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TMOD3Q9NYL9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TMOD3Q9NYL9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TMOD3Q9NYL9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TMOD3Q9NYL9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TMOD3Q9NYL9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TMOD3Q9NYL9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TMOD3Q9NYL9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TMOD3Q9NYL9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TMOD3Q9NYL9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TMOD3Q9NYL9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TMOD3Q9NYL9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TMOD3Q9NYL9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TMOD3Q9NYL9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TMOD3Q9NYL9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TMOD3Q9NYL9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TMOD3Q9NYL9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TMOD3Q9NYL9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms