Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTNAP3Q9BZ76 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTNAP3Q9BZ76 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP3Q9BZ76 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTNAP3Q9BZ76 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP3Q9BZ76 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP3Q9BZ76 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP3Q9BZ76 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTNAP3Q9BZ76 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTNAP3Q9BZ76 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP3Q9BZ76 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTNAP3Q9BZ76 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNTNAP3Q9BZ76 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTNAP3Q9BZ76 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP3Q9BZ76 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP3Q9BZ76 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTNAP3Q9BZ76 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTNAP3Q9BZ76 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTNAP3Q9BZ76 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP3Q9BZ76 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP3Q9BZ76 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP3Q9BZ76 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP3Q9BZ76 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP3Q9BZ76 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP3Q9BZ76 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP3Q9BZ76 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP3Q9BZ76 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP3Q9BZ76 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP3Q9BZ76 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP3Q9BZ76 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP3Q9BZ76 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP3Q9BZ76 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CNTNAP3Q9BZ76 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP3Q9BZ76 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNTNAP3Q9BZ76 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNTNAP3Q9BZ76 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP3Q9BZ76 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNTNAP3Q9BZ76 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP3Q9BZ76 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP3Q9BZ76 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNTNAP3Q9BZ76 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP3Q9BZ76 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP3Q9BZ76 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNTNAP3Q9BZ76 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP3Q9BZ76 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNTNAP3Q9BZ76 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNTNAP3Q9BZ76 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTNAP3Q9BZ76 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTNAP3Q9BZ76 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTNAP3Q9BZ76 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP3Q9BZ76 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms