Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
VPS8Q8N3P4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
VPS8Q8N3P4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
VPS8Q8N3P4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
VPS8Q8N3P4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
VPS8Q8N3P4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
VPS8Q8N3P4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
VPS8Q8N3P4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
VPS8Q8N3P4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
VPS8Q8N3P4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
VPS8Q8N3P4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
VPS8Q8N3P4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
VPS8Q8N3P4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
VPS8Q8N3P4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
VPS8Q8N3P4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
VPS8Q8N3P4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC42.21■■■■■ 4.35
VPS8Q8N3P4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
VPS8Q8N3P4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
VPS8Q8N3P4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.35
VPS8Q8N3P4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
VPS8Q8N3P4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
VPS8Q8N3P4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
VPS8Q8N3P4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
VPS8Q8N3P4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
VPS8Q8N3P4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
VPS8Q8N3P4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
VPS8Q8N3P4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
VPS8Q8N3P4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
VPS8Q8N3P4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
VPS8Q8N3P4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
VPS8Q8N3P4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
VPS8Q8N3P4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
VPS8Q8N3P4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
VPS8Q8N3P4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
VPS8Q8N3P4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
VPS8Q8N3P4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
VPS8Q8N3P4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
VPS8Q8N3P4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC42.1■■■■■ 4.33
VPS8Q8N3P4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC42.1■■■■■ 4.33
VPS8Q8N3P4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.09■■■■■ 4.33
VPS8Q8N3P4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
VPS8Q8N3P4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
VPS8Q8N3P4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
VPS8Q8N3P4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
VPS8Q8N3P4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
VPS8Q8N3P4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC42.05■■■■■ 4.32
VPS8Q8N3P4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
VPS8Q8N3P4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
VPS8Q8N3P4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
VPS8Q8N3P4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
VPS8Q8N3P4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
VPS8Q8N3P4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
VPS8Q8N3P4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
VPS8Q8N3P4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
VPS8Q8N3P4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
VPS8Q8N3P4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
VPS8Q8N3P4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.99■■■■■ 4.31
VPS8Q8N3P4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
VPS8Q8N3P4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
VPS8Q8N3P4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
VPS8Q8N3P4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
VPS8Q8N3P4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
VPS8Q8N3P4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
VPS8Q8N3P4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
VPS8Q8N3P4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.94■■■■■ 4.3
VPS8Q8N3P4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
VPS8Q8N3P4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
VPS8Q8N3P4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
VPS8Q8N3P4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
VPS8Q8N3P4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
VPS8Q8N3P4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
VPS8Q8N3P4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
VPS8Q8N3P4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
VPS8Q8N3P4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.3
VPS8Q8N3P4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.88■■■■■ 4.3
VPS8Q8N3P4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
VPS8Q8N3P4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
VPS8Q8N3P4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
VPS8Q8N3P4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
VPS8Q8N3P4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
VPS8Q8N3P4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
VPS8Q8N3P4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
VPS8Q8N3P4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
VPS8Q8N3P4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
VPS8Q8N3P4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
VPS8Q8N3P4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
VPS8Q8N3P4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
VPS8Q8N3P4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
VPS8Q8N3P4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
VPS8Q8N3P4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
VPS8Q8N3P4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
VPS8Q8N3P4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
VPS8Q8N3P4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
VPS8Q8N3P4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
VPS8Q8N3P4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
VPS8Q8N3P4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
VPS8Q8N3P4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
VPS8Q8N3P4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
VPS8Q8N3P4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.27
VPS8Q8N3P4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms