Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLRC3Q7RTR2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRC3Q7RTR2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC3Q7RTR2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC3Q7RTR2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRC3Q7RTR2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC3Q7RTR2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC3Q7RTR2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRC3Q7RTR2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC3Q7RTR2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC3Q7RTR2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC3Q7RTR2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRC3Q7RTR2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC3Q7RTR2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRC3Q7RTR2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRC3Q7RTR2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRC3Q7RTR2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRC3Q7RTR2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRC3Q7RTR2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRC3Q7RTR2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC3Q7RTR2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms