Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.51■■■■■ 4.23
PREX2Q70Z35 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
PREX2Q70Z35 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
PREX2Q70Z35 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
PREX2Q70Z35 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
PREX2Q70Z35 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
PREX2Q70Z35 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
PREX2Q70Z35 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
PREX2Q70Z35 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
PREX2Q70Z35 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
PREX2Q70Z35 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
PREX2Q70Z35 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
PREX2Q70Z35 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
PREX2Q70Z35 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
PREX2Q70Z35 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
PREX2Q70Z35 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
PREX2Q70Z35 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
PREX2Q70Z35 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
PREX2Q70Z35 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.4■■■■■ 4.22
PREX2Q70Z35 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
PREX2Q70Z35 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
PREX2Q70Z35 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
PREX2Q70Z35 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PREX2Q70Z35 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
PREX2Q70Z35 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
PREX2Q70Z35 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
PREX2Q70Z35 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC41.36■■■■■ 4.21
PREX2Q70Z35 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PREX2Q70Z35 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PREX2Q70Z35 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
PREX2Q70Z35 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
PREX2Q70Z35 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
PREX2Q70Z35 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
PREX2Q70Z35 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
PREX2Q70Z35 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
PREX2Q70Z35 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
PREX2Q70Z35 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
PREX2Q70Z35 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PREX2Q70Z35 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PREX2Q70Z35 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
PREX2Q70Z35 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
PREX2Q70Z35 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
PREX2Q70Z35 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
PREX2Q70Z35 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
PREX2Q70Z35 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
PREX2Q70Z35 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PREX2Q70Z35 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PREX2Q70Z35 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PREX2Q70Z35 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.22■■■■■ 4.19
PREX2Q70Z35 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
PREX2Q70Z35 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
PREX2Q70Z35 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PREX2Q70Z35 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PREX2Q70Z35 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
PREX2Q70Z35 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
PREX2Q70Z35 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
PREX2Q70Z35 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PREX2Q70Z35 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PREX2Q70Z35 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PREX2Q70Z35 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PREX2Q70Z35 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PREX2Q70Z35 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PREX2Q70Z35 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
PREX2Q70Z35 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
PREX2Q70Z35 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.13■■■■■ 4.17
PREX2Q70Z35 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
PREX2Q70Z35 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
PREX2Q70Z35 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PREX2Q70Z35 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
PREX2Q70Z35 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
PREX2Q70Z35 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PREX2Q70Z35 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
PREX2Q70Z35 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PREX2Q70Z35 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
PREX2Q70Z35 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PREX2Q70Z35 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PREX2Q70Z35 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PREX2Q70Z35 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PREX2Q70Z35 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PREX2Q70Z35 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
PREX2Q70Z35 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PREX2Q70Z35 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.99■■■■■ 4.15
PREX2Q70Z35 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
PREX2Q70Z35 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PREX2Q70Z35 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PREX2Q70Z35 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PREX2Q70Z35 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
PREX2Q70Z35 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
PREX2Q70Z35 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PREX2Q70Z35 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PREX2Q70Z35 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
PREX2Q70Z35 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PREX2Q70Z35 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PREX2Q70Z35 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
PREX2Q70Z35 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
PREX2Q70Z35 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
PREX2Q70Z35 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
PREX2Q70Z35 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms