Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN5AQ14524 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN5AQ14524 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN5AQ14524 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN5AQ14524 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCN5AQ14524 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCN5AQ14524 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN5AQ14524 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN5AQ14524 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN5AQ14524 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN5AQ14524 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCN5AQ14524 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCN5AQ14524 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCN5AQ14524 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SCN5AQ14524 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SCN5AQ14524 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SCN5AQ14524 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN5AQ14524 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCN5AQ14524 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCN5AQ14524 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCN5AQ14524 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCN5AQ14524 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN5AQ14524 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN5AQ14524 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN5AQ14524 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN5AQ14524 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN5AQ14524 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCN5AQ14524 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCN5AQ14524 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN5AQ14524 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN5AQ14524 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN5AQ14524 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN5AQ14524 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN5AQ14524 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCN5AQ14524 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCN5AQ14524 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN5AQ14524 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SCN5AQ14524 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCN5AQ14524 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SCN5AQ14524 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCN5AQ14524 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCN5AQ14524 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCN5AQ14524 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCN5AQ14524 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCN5AQ14524 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCN5AQ14524 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCN5AQ14524 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCN5AQ14524 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCN5AQ14524 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCN5AQ14524 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCN5AQ14524 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCN5AQ14524 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCN5AQ14524 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCN5AQ14524 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCN5AQ14524 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCN5AQ14524 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCN5AQ14524 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCN5AQ14524 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCN5AQ14524 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCN5AQ14524 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCN5AQ14524 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN5AQ14524 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCN5AQ14524 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCN5AQ14524 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCN5AQ14524 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
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