Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 RNF25-204ENST00000473034 1807 ntTSL 217.83■□□□□ 0.441e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 FAM98A-205ENST00000474985 3546 ntTSL 216.82■□□□□ 0.281e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 MCM5-207ENST00000464908 554 ntTSL 416.81■□□□□ 0.282e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.11e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 UBOX5-202ENST00000348031 4469 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.051e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 RNF25-205ENST00000474339 532 ntTSL 214.88□□□□□ -0.031e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 UBOX5-201ENST00000217173 4631 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 AIFM1-208ENST00000533719 845 ntTSL 213.37□□□□□ -0.271e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 AIFM1-206ENST00000527892 2105 ntTSL 212.35□□□□□ -0.431e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 AIFM1-205ENST00000460436 1925 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.871e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 NGDN-205ENST00000555128 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 28.04□□□□□ -1.122e-6■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 CHD8-212ENST00000557329 578 ntTSL 24.14□□□□□ -1.751e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.871e-6■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 PPME1-208ENST00000543525 1928 ntTSL 1 (best)16.23■□□□□ 0.199e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.079e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 PPME1-202ENST00000398427 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.159e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 PPME1-203ENST00000535205 636 ntTSL 28.55□□□□□ -1.049e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 PRDX1-204ENST00000424390 795 ntTSL 217.21■□□□□ 0.357e-12■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 PRDX1-205ENST00000447184 606 ntTSL 510.05□□□□□ -0.87e-12■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.392e-9■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 IL32-214ENST00000528652 519 ntTSL 323.83■■□□□ 1.416e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-221ENST00000532247 1381 ntTSL 1 (best)21.57■■□□□ 1.046e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.926e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.926e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.876e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.876e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.876e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-228ENST00000548807 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.46■□□□□ 0.876e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.876e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.876e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.876e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-209ENST00000525228 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 420.43■□□□□ 0.866e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.846e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.846e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.726e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-210ENST00000525377 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.57■□□□□ 0.726e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.726e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.726e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.76e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.76e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.666e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.636e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.636e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.66e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.66e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.596e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.576e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.186e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-204ENST00000396887 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.066e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-229ENST00000549213 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.196e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-216ENST00000529699 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.386e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 IL32-225ENST00000548246 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.386e-11■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 PABPC1-217ENST00000521067 492 ntTSL 325.04■■□□□ 1.69e-14■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 PABPC1-215ENST00000520804 493 ntTSL 224.26■■□□□ 1.479e-14■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 PABPC1-210ENST00000519363 453 ntTSL 418.45■□□□□ 0.549e-14■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 524.02■■□□□ 1.442e-9■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.632e-9■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.392e-9■■■■□ 26.5
G3BP1Q13283 SRRT-204ENST00000448764 1607 ntTSL 520.92■□□□□ 0.941e-7■■■■□ 26.4
G3BP1Q13283 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.624e-6■■■■□ 26.4
G3BP1Q13283 ATP5B-209ENST00000551570 399 ntTSL 310.09□□□□□ -0.793e-15■■■■□ 26.4
G3BP1Q13283 PPP2R1A-210ENST00000490868 668 ntTSL 219.22■□□□□ 0.673e-7■■■■□ 26.3
G3BP1Q13283 PPP2R1A-206ENST00000468280 688 ntTSL 215.83■□□□□ 0.123e-7■■■■□ 26.3
G3BP1Q13283 PPP2R1A-207ENST00000473455 615 ntTSL 315.52■□□□□ 0.083e-7■■■■□ 26.3
G3BP1Q13283 PPP2R1A-211ENST00000495876 562 ntTSL 411.75□□□□□ -0.533e-7■■■■□ 26.3
G3BP1Q13283 LDHA-219ENST00000541097 582 ntTSL 38.43□□□□□ -1.067e-16■■■■□ 26.3
G3BP1Q13283 CHD4-206ENST00000536999 318 ntTSL 36.78□□□□□ -1.324e-8■■■■□ 26.3
G3BP1Q13283 PSMD2-211ENST00000466987 530 ntTSL 213.09□□□□□ -0.317e-7■■■■□ 26.3
G3BP1Q13283 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 26.2
G3BP1Q13283 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.511e-6■■■■□ 26.2
G3BP1Q13283 MED12-206ENST00000460771 330 ntTSL 211.54□□□□□ -0.561e-6■■■■□ 26.2
G3BP1Q13283 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.731e-6■■■■□ 26.2
G3BP1Q13283 ALDH3A2-216ENST00000578614 527 ntTSL 419.16■□□□□ 0.664e-14■■■■□ 26.2
G3BP1Q13283 ALDH3A2-217ENST00000578696 400 ntTSL 34.55□□□□□ -1.684e-14■■■■□ 26.2
G3BP1Q13283 ALDH3A2-209ENST00000571537 607 ntTSL 24.3□□□□□ -1.724e-14■■■■□ 26.2
G3BP1Q13283 IARS2-204ENST00000490891 447 ntTSL 310□□□□□ -0.811e-8■■■■□ 26.2
G3BP1Q13283 PSMD2-203ENST00000432855 609 ntTSL 311.61□□□□□ -0.553e-7■■■■□ 26.1
G3BP1Q13283 MCM4-206ENST00000519138 927 ntTSL 215.52■□□□□ 0.086e-8■■■■□ 26.1
G3BP1Q13283 VARS-224ENST00000479051 612 ntTSL 325.4■■□□□ 1.662e-6■■■■□ 26.1
G3BP1Q13283 LDHA-220ENST00000542179 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.586e-16■■■■□ 26.1
G3BP1Q13283 NUP93-221ENST00000569863 630 ntTSL 420.92■□□□□ 0.947e-7■■■■□ 26.1
G3BP1Q13283 NUP93-203ENST00000562496 583 ntTSL 417.95■□□□□ 0.467e-7■■■■□ 26.1
G3BP1Q13283 NUP93-211ENST00000566315 589 ntTSL 414.93□□□□□ -0.027e-7■■■■□ 26.1
G3BP1Q13283 NUP93-216ENST00000568283 584 ntTSL 412.69□□□□□ -0.387e-7■■■■□ 26.1
G3BP1Q13283 NUP93-217ENST00000568656 592 ntTSL 411.56□□□□□ -0.567e-7■■■■□ 26.1
G3BP1Q13283 NUP93-214ENST00000567081 315 ntTSL 311.32□□□□□ -0.67e-7■■■■□ 26.1
G3BP1Q13283 NUP93-212ENST00000566678 442 ntTSL 211.31□□□□□ -0.67e-7■■■■□ 26.1
G3BP1Q13283 NUP93-219ENST00000569595 590 ntTSL 410.85□□□□□ -0.677e-7■■■■□ 26.1
G3BP1Q13283 NUP93-215ENST00000567641 604 ntTSL 49.75□□□□□ -0.857e-7■■■■□ 26.1
G3BP1Q13283 NUP93-213ENST00000566727 563 ntTSL 49.51□□□□□ -0.897e-7■■■■□ 26.1
G3BP1Q13283 RPS25-201ENST00000524864 1078 ntTSL 217■□□□□ 0.313e-8■■■■□ 26.1
G3BP1Q13283 USP5-204ENST00000537267 2522 ntTSL 516.54■□□□□ 0.248e-7■■■■□ 26
G3BP1Q13283 CLTC-212ENST00000580081 575 ntTSL 410.83□□□□□ -0.683e-27■■■■□ 26
G3BP1Q13283 ELAC2-211ENST00000492559 615 ntTSL 413.55□□□□□ -0.244e-7■■■■□ 26
G3BP1Q13283 CNOT1-205ENST00000563283 551 ntTSL 36.24□□□□□ -1.414e-7■■■■□ 26
G3BP1Q13283 MSH6-207ENST00000456246 846 ntTSL 322.09■■□□□ 1.138e-7■■■■□ 26
G3BP1Q13283 NSFL1C-211ENST00000555359 450 ntTSL 325.97■■□□□ 1.751e-8■■■■□ 26
G3BP1Q13283 NSFL1C-207ENST00000478168 624 ntTSL 225.97■■□□□ 1.751e-8■■■■□ 26
G3BP1Q13283 NSFL1C-208ENST00000487086 456 ntTSL 220.65■□□□□ 0.91e-8■■■■□ 26
G3BP1Q13283 CKAP5-205ENST00000526496 582 ntTSL 25.02□□□□□ -1.616e-10■■■■□ 25.9
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 777.2 ms