RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520804.1

PABPC1-215, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2

Gene PABPC1, Length 493 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-215ENST00000520804 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.12■■■■■ 5.45
PABPC1-215ENST00000520804 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.02■■■■■ 4.64
PABPC1-215ENST00000520804 ABCC9O60706 1549 aa43.85■■■■■ 4.61
PABPC1-215ENST00000520804 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.82■■■■■ 4.29
PABPC1-215ENST00000520804 NACADO15069 1562 aa41.59■■■■■ 4.25
PABPC1-215ENST00000520804 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.35■■■■■ 4.21
PABPC1-215ENST00000520804 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.08■■■■■ 4.17
PABPC1-215ENST00000520804 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.01■■■■■ 4.16
PABPC1-215ENST00000520804 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.87■■■■■ 4.13
PABPC1-215ENST00000520804 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.84■■■■■ 4.13
PABPC1-215ENST00000520804 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
PABPC1-215ENST00000520804 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.61■■■■■ 4.09
PABPC1-215ENST00000520804 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.6■■■■■ 4.09
PABPC1-215ENST00000520804 SCRIBQ14160 1630 aa40.09■■■■■ 4.01
PABPC1-215ENST00000520804 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.08■■■■■ 4.01
PABPC1-215ENST00000520804 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.63■■■■□ 3.93
PABPC1-215ENST00000520804 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
PABPC1-215ENST00000520804 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.49■■■■□ 3.91
PABPC1-215ENST00000520804 NCAPD3P42695 1498 aa38.39■■■■□ 3.74
PABPC1-215ENST00000520804 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.28■■■■□ 3.72
PABPC1-215ENST00000520804 SMARCA4P51532 1647 aa38.27■■■■□ 3.72
PABPC1-215ENST00000520804 SMARCA2P51531 1590 aa38.19■■■■□ 3.7
PABPC1-215ENST00000520804 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
PABPC1-215ENST00000520804 HMGXB3Q12766 1538 aa38.11■■■■□ 3.69
PABPC1-215ENST00000520804 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.93■■■■□ 3.66
PABPC1-215ENST00000520804 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
PABPC1-215ENST00000520804 ERCC6Q03468 1493 aa37.85■■■■□ 3.65
PABPC1-215ENST00000520804 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.84■■■■□ 3.65
PABPC1-215ENST00000520804 CUX2O14529 1486 aa37.75■■■■□ 3.63
PABPC1-215ENST00000520804 NESP48681 1621 aa37.72■■■■□ 3.63
PABPC1-215ENST00000520804 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.57■■■■□ 3.6
PABPC1-215ENST00000520804 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.5■■■■□ 3.59
PABPC1-215ENST00000520804 WIZO95785 1651 aa37.39■■■■□ 3.58
PABPC1-215ENST00000520804 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.56
PABPC1-215ENST00000520804 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.27■■■■□ 3.56
PABPC1-215ENST00000520804 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.24■■■■□ 3.55
PABPC1-215ENST00000520804 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.22■■■■□ 3.55
PABPC1-215ENST00000520804 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
PABPC1-215ENST00000520804 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
PABPC1-215ENST00000520804 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.94■■■■□ 3.5
PABPC1-215ENST00000520804 WDR62O43379 1518 aa36.85■■■■□ 3.49
PABPC1-215ENST00000520804 CFTRP13569 1480 aa36.83■■■■□ 3.49
PABPC1-215ENST00000520804 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.82■■■■□ 3.48
PABPC1-215ENST00000520804 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.79■■■■□ 3.48
PABPC1-215ENST00000520804 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.51■■■■□ 3.44
PABPC1-215ENST00000520804 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
PABPC1-215ENST00000520804 PRDM2Q13029 1718 aa36.47■■■■□ 3.43
PABPC1-215ENST00000520804 TOPBP1Q92547 1522 aa36.12■■■■□ 3.37
PABPC1-215ENST00000520804 IFT140Q96RY7 1462 aa36.08■■■■□ 3.37
PABPC1-215ENST00000520804 ABCC8Q09428 1581 aa36.06■■■■□ 3.36
PABPC1-215ENST00000520804 OSCARQ8IYS5 282 aa36.04■■■■□ 3.36
PABPC1-215ENST00000520804 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
PABPC1-215ENST00000520804 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36■■■■□ 3.35
PABPC1-215ENST00000520804 TRIM41Q8WV44 630 aa35.95■■■■□ 3.35
PABPC1-215ENST00000520804 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
PABPC1-215ENST00000520804 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
PABPC1-215ENST00000520804 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
PABPC1-215ENST00000520804 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.68■■■■□ 3.39e-6■■□□□ 13.1
PABPC1-215ENST00000520804 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.61■■■■□ 3.29
PABPC1-215ENST00000520804 SOGA1O94964 1423 aa35.59■■■■□ 3.29
PABPC1-215ENST00000520804 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.56■■■■□ 3.28
PABPC1-215ENST00000520804 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.56■■■■□ 3.28
PABPC1-215ENST00000520804 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.56■■■■□ 3.28
PABPC1-215ENST00000520804 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.54■■■■□ 3.28
PABPC1-215ENST00000520804 CUX1P39880 1505 aa35.54■■■■□ 3.28
PABPC1-215ENST00000520804 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PABPC1-215ENST00000520804 CHD1O14646 1710 aa35.52■■■■□ 3.28
PABPC1-215ENST00000520804 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
PABPC1-215ENST00000520804 ARHGEF11O15085 1522 aa35.47■■■■□ 3.27
PABPC1-215ENST00000520804 WDR97A6NE52 1622 aa35.45■■■■□ 3.27
PABPC1-215ENST00000520804 FBLN2P98095 1184 aa35.41■■■■□ 3.26
PABPC1-215ENST00000520804 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.34■■■■□ 3.25
PABPC1-215ENST00000520804 GRIN2BQ13224 1484 aa35.27■■■■□ 3.24
PABPC1-215ENST00000520804 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.23
PABPC1-215ENST00000520804 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.19■■■■□ 3.22
PABPC1-215ENST00000520804 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
PABPC1-215ENST00000520804 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.16■■■■□ 3.22
PABPC1-215ENST00000520804 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.16■■■■□ 3.22
PABPC1-215ENST00000520804 PBRM1Q86U86 1689 aa35.14■■■■□ 3.22
PABPC1-215ENST00000520804 SYNJ2O15056 1496 aa35.14■■■■□ 3.22
PABPC1-215ENST00000520804 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.13■■■■□ 3.21
PABPC1-215ENST00000520804 ARAP1Q96P48 1450 aa35.13■■■■□ 3.21
PABPC1-215ENST00000520804 SYNJ1O43426 1573 aa35.12■■■■□ 3.21
PABPC1-215ENST00000520804 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.1■■■■□ 3.21
PABPC1-215ENST00000520804 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.04■■■■□ 3.2
PABPC1-215ENST00000520804 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.03■■■■□ 3.2
PABPC1-215ENST00000520804 TOP2BQ02880 1626 aa35.02■■■■□ 3.2
PABPC1-215ENST00000520804 GRIN2AQ12879 1464 aa34.82■■■■□ 3.16
PABPC1-215ENST00000520804 ADAMTS12P58397 1594 aa34.82■■■■□ 3.16
PABPC1-215ENST00000520804 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
PABPC1-215ENST00000520804 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.73■■■■□ 3.15
PABPC1-215ENST00000520804 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.72■■■■□ 3.15
PABPC1-215ENST00000520804 NUP160Q12769 1436 aa34.71■■■■□ 3.15
PABPC1-215ENST00000520804 CEP170Q5SW79 1584 aa34.69■■■■□ 3.14
PABPC1-215ENST00000520804 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.58■■■■□ 3.13
PABPC1-215ENST00000520804 SHROOM2Q13796 1616 aa34.54■■■■□ 3.12
PABPC1-215ENST00000520804 KIF27Q86VH2 1401 aa34.34■■■■□ 3.09
PABPC1-215ENST00000520804 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
PABPC1-215ENST00000520804 JPH4Q96JJ6 628 aa34.34■■■■□ 3.09
PABPC1-215ENST00000520804 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.33■■■■□ 3.09
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