Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFF3Q07654 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFF3Q07654 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF3Q07654 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF3Q07654 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF3Q07654 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFF3Q07654 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFF3Q07654 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFF3Q07654 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TFF3Q07654 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF3Q07654 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF3Q07654 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TFF3Q07654 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF3Q07654 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF3Q07654 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF3Q07654 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TFF3Q07654 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFF3Q07654 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFF3Q07654 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFF3Q07654 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFF3Q07654 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFF3Q07654 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFF3Q07654 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFF3Q07654 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFF3Q07654 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFF3Q07654 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFF3Q07654 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFF3Q07654 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFF3Q07654 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFF3Q07654 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFF3Q07654 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFF3Q07654 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFF3Q07654 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms