Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPD2P62316 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPD2P62316 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRPD2P62316 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPD2P62316 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPD2P62316 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPD2P62316 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPD2P62316 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPD2P62316 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPD2P62316 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPD2P62316 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPD2P62316 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPD2P62316 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPD2P62316 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPD2P62316 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPD2P62316 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPD2P62316 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRPD2P62316 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPD2P62316 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPD2P62316 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms