Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SNRPEP62304 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNRPEP62304 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNRPEP62304 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNRPEP62304 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPEP62304 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPEP62304 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNRPEP62304 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPEP62304 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPEP62304 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPEP62304 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPEP62304 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNRPEP62304 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNRPEP62304 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPEP62304 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPEP62304 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNRPEP62304 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNRPEP62304 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SNRPEP62304 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNRPEP62304 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNRPEP62304 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNRPEP62304 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNRPEP62304 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNRPEP62304 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNRPEP62304 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNRPEP62304 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNRPEP62304 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNRPEP62304 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNRPEP62304 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNRPEP62304 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNRPEP62304 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNRPEP62304 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNRPEP62304 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNRPEP62304 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms