Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GJA8P48165 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GJA8P48165 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GJA8P48165 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GJA8P48165 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GJA8P48165 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GJA8P48165 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GJA8P48165 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GJA8P48165 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJA8P48165 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GJA8P48165 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJA8P48165 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJA8P48165 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJA8P48165 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJA8P48165 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJA8P48165 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJA8P48165 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GJA8P48165 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GJA8P48165 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GJA8P48165 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GJA8P48165 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GJA8P48165 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJA8P48165 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GJA8P48165 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJA8P48165 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJA8P48165 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJA8P48165 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GJA8P48165 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJA8P48165 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJA8P48165 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJA8P48165 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJA8P48165 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GJA8P48165 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJA8P48165 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJA8P48165 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJA8P48165 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJA8P48165 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJA8P48165 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GJA8P48165 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJA8P48165 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJA8P48165 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJA8P48165 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJA8P48165 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GJA8P48165 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GJA8P48165 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GJA8P48165 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJA8P48165 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA8P48165 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA8P48165 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA8P48165 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA8P48165 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA8P48165 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA8P48165 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA8P48165 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA8P48165 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA8P48165 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA8P48165 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA8P48165 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GJA8P48165 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GJA8P48165 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJA8P48165 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJA8P48165 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJA8P48165 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJA8P48165 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJA8P48165 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GJA8P48165 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJA8P48165 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJA8P48165 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJA8P48165 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJA8P48165 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA8P48165 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA8P48165 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJA8P48165 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJA8P48165 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJA8P48165 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJA8P48165 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJA8P48165 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJA8P48165 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJA8P48165 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GJA8P48165 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA8P48165 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA8P48165 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA8P48165 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA8P48165 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA8P48165 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA8P48165 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA8P48165 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA8P48165 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA8P48165 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA8P48165 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GJA8P48165 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GJA8P48165 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJA8P48165 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJA8P48165 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJA8P48165 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJA8P48165 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJA8P48165 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJA8P48165 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJA8P48165 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GJA8P48165 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms